Questo articolo fornisce una panoramica dettagliata degli argomenti fondamentali per la preparazione all'esame di citologia a livello universitario. Si concentra sulle principali classi di molecole biologiche, sulle loro funzioni e sulla loro importanza per la vita cellulare.
I Gruppi Fondamentali di Molecole Biologiche
Le molecole biologiche sono essenziali per la struttura e la funzione delle cellule. Di seguito sono elencati i gruppi principali e le loro funzioni:
- Glucidi: Fonte di energia in tutti gli organismi e componenti strutturali nelle piante.
- Lipidi: Riserva di energia e componenti strutturali delle membrane cellulari, oltre a fattori di regolazione di processi biochimici.
- Proteine: Componenti strutturali e fattori di regolazione di numerosi processi biochimici.
- Acidi Nucleici: Supporto delle informazioni genetiche e della loro trasmissione.
Glucidi
Per funzionare in ambito biologico, i glucidi necessitano di un gruppo aldeide o chetone. Principalmente, i glucidi hanno due forme tridimensionali: lineari e/o circolari. Essi molto spesso si dividono in isomeri, ovvero una stessa molecola di glucosio (es.) ma posizionata nello spazio diversamente (diversi centri di simmetria): in base ai gruppi legati al carbonio abbiamo la forma D e la forma L; mentre in base al gruppo ossidrile OH del primo carbonio (C1) abbiamo la forma “Alfa” e “Beta”.
La differenza dei due isomeri in base al gruppo OH del C1 sta principalmente nel fatto che gli isomeri “Alfa” formano, combinandosi tra di loro, l’amido e gli isomeri “Beta” formano, combinandosi tra di loro, la cellulosa.
Nella forma alfa esiste una differenza in base a come si sviluppa nello spazio: esiste l’amiloso dove ci sono tutti legami 1-4 (tra gli atomi di carbonio) e l’amilopectina dove ogni 26 legami 1-4 ne troviamo uno 1-6 (tra gli atomi di carbonio). La prima ha una forma completamente lineare mentre la seconda ha una forma ramificata (Glicogeno).
I glucidi tra di loro e tra i diversi monomeri di una catena glucidica si uniscono attraverso un legame glicosidico (sintesi) e si dividono attraverso l’idrolisi (distruzione). Nel legame glicosidico si legano attraverso il gruppo OH del C1.
Un'altra tipologia di glucidi importante sono i GAG, o meglio chiamati, Glicosamminoglicani che hanno delle funzioni ben precise nel nostro organismo (es. acido ialuronico, cheratina, dermatina). Questi glucidi specifici sono idrofili, cioè riescono a far penetrare l’acqua ed ad assorbirla; e basofili, cioè hanno la caratteristica di colorarsi in maniera elettiva con i coloranti basici dell’anilina.
Infine, esistono dei glicoconiugati che svolgono azioni ben precise: i proteoglicani, composti dal 5% di proteine (core/protein) e il 95% di glucidi (GAG); le glicoproteine, composte dal 40% di proteine e il 60% di glucidi, e i glicolipidi, composti dal 40% di lipidi e il 60% di glucidi, i quali sono responsabili delle comunicazioni intracellulari e connettive dell’organismo.
Proteine
Le proteine principalmente si dividono in semplici (50% di C, 23% di O, 16% di N, 7% di H (e max 3% di S)) e complessi (Proteina + Prostetico (glu - lip)). Nelle cellule esiste anche un raggruppamento di amminoacidi chiamato Pool di amminoacidi, derivanti dalla demolizione delle proteine della dieta ecc.
Anche gli amminoacidi (unità di misura delle proteine) hanno 2 isomeri D e L dovuti al centro di simmetria del C, ma in natura si trovano solamente in forma D.
Il gruppo caratteristico R dell’amminoacido rappresenta la caratteristica dell’amminoacido e quindi della proteina stessa: può essere idrofila o idrofoba, che cambia la sua Stericità (conformazione spaziale) e funzione.
Nel suo ripiegamento (Folding) la proteina interagisce con se stessa attraverso legami chimici deboli come: Ponti H, Interazioni ioniche (COO e il NH3), interazioni idrofobiche, forze di Van Der Waart. Tutte queste forze donano la struttura alla proteina e quindi anche la funzione (Paradigma struttura/funzione delle proteine) (ES. se si trovano entro gli 0,3 nm si legano in Ponti H per formare la struttura secondaria).
Una sezione importantissima di proteine sono gli Enzimi: essi regolano l’intera gamma delle reazioni metaboliche cellulari (metabolismo = insieme delle reazioni di anabolismo (sintesi) e catabolismo (demolizione)). In altre parole, gli enzimi sono i catalizzatori biologici che abbassano l’energia di attivazione (quantità di calore necessaria per la reazione chimica) detta anche Catalisi.
Sono formati principalmente da Proteine (Apoenzima) e molto spesso troviamo il gruppo prostetico (coenzima) composto o da Vitamine o residui metallici.
La stericità dell’enzima è complementare con il substrato da metabolizzare, perciò ogni enzima agisce su uno specifico substrato.
In base al tipo di reazione catalizzata, gli enzimi si classificano in:
- Ossidoreduttasi
- Transferasi
- Idrolasi (proteasi, esterasi, glucosidasi)
- Sintetasi
- Isomerasi
- Liasi
Lipidi
L’acido grasso è una lunga catena di molecole idrocarburiche con un numero pari di atomi di carbonio e con un gruppo carbossilico COOH iniziale e un gruppo metilico CH3 finale.
Iniziale e finale perché dal COOH si inizia a contare il numero di C con 1, 2, 3. Per il nome dell’acido grasso si segue questo schema: Acido (N° di C)-noico. (ES. C18 -> Acido ottadecanoico); se invece si ha un doppio legame, prima si scrive Cis seguito dal numero del carbonio con il doppio legame e finito come sempre.
I lipidi si possono dividere in semplici (Cere, Gliceridi, Steroli) e complessi (formati da una parte lipidica e un altro composto)…quando quest’unione forma una molecola con una parte idrofila (quindi Polare) e una parte idrofoba si chiamano molecole Antipatiche.
Acidi Nucleici
Gli acidi nucleici sono polinucleotidi, formati dall’unione di monomeri chiamati nucleotidi. Essi sono composti da:
- Pentoso (zucchero con 5 atomi di C) che si differenzia in Ribosio (RNA) e desossiriboso (DNA)
- Base azotata (Contenente Azoto) che si differenzia in pirimidiniche formati da un solo anello (Timina, Citosina, Uracile) e puriniche formate da 2 anelli (Adenina e Guanina)
- Radicale fosforico composto principalmente da gruppi fosfato legati al carbonio (5 e 3) attraverso legami covalenti (fosfodiestere)
La differenza tra DNA e RNA sta nello zucchero, nelle basi azotate corrispondenti (DNA = T; RNA = U) e nella struttura secondaria.
Il DNA è composto da due filamenti di scheletro zucchero fosfato legato dal legame covalente fosfodiesterico antiparalleli (5 e 3 con 3 e 5) con basi azotate complementari unite da legami idrogeno e sviluppato tridimensionalmente in elica, con specifica forma B (Solco maggiore e solco minore). La complementarietà delle basi, secondo motivi stereochimici, avviene tra A - T con la formazione di 2 legami H e tra C - G con formazione di 3 legami H. Queste complementarietà sono alla base della replicazione del DNA e dal mantenimento della stessa distanza tra basi azotate (0,34 nm) e lo stesso diametro dell’elica di DNA (2 nm).
L’RNA è composto da un singolo filamento solitario o avvolte unito su se stesso tramite complementarietà delle basi azotate. Ogni RNA è trascritto da un gene nel DNA. Esistono 3 tipi principali:
- mRNA (RNA messaggero): Costituito da un filamento di polinucleotidi, avvolte ripiegato ad elica, suddivisibile in codoni (gruppi di 3 basi azotate) e lungo in proporzione agli amminoacidi da tradurre (Sintesi Proteica). Infatti, la sua funzione è la trascrizione nell’espressione genica.
- tRNA (RNA transfer): Costituito da un filamento polinucleotidico, formato da 75 a 90 nucleotidi, ripiegato su se stesso per formare una forma a “Trifoglio” dovuto alla formazione di 3 ansa (D, anticodone, T). La funzione dell’tRNA è quella di trasportare l’amminoacido dal pool degli amminoacidi al ribosoma per eseguire la traduzione proteica. Infatti, all’estremità 3 dell’RNA troviamo una tripletta caratteristica di ogni tRNA (CCA) che corrisponde al sito accettatore dell’amminoacido.
- rRNA (RNA ribosomiale): Nome dovuto poiché costituente dei ribosomi, organuli adibiti alla sintesi delle proteine. Essi sono formati da due parti diseguali: la subunità minore contenente 1 rRNA e la subunità maggiore contenente 2-3 rRNA. Queste due unità sono legate tra loro solo al momento della sintesi proteica.
Tabella Riassuntiva delle Molecole Biologiche
| Gruppo di Molecole | Funzione Principale | Esempi |
|---|---|---|
| Glucidi | Fonte di energia, componenti strutturali | Amido, cellulosa, acido ialuronico |
| Lipidi | Riserva di energia, componenti delle membrane | Gliceridi, steroli, cere |
| Proteine | Componenti strutturali, enzimi, regolazione | Enzimi, anticorpi |
| Acidi Nucleici | Supporto e trasmissione informazioni genetiche | DNA, RNA (mRNA, tRNA, rRNA) |
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